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DNA分子在微纳米通道的分子动力学模拟
 
     论文目录
 
摘要第1-5页
Abstract第5-8页
引言第8-10页
1 文献综述第10-17页
   ·课题的提出及研究背景第10-11页
   ·模拟DNA运动的方法简介第11-12页
     ·蒙特卡罗计算法第11页
     ·布朗动力学模拟第11-12页
     ·耗散粒子动力学模拟第12页
     ·分子动力学模拟第12页
   ·分离DNA链的国内外研究现状第12-15页
   ·本文主要研究内容第15-17页
2 电动现象及分子动力学模拟第17-27页
   ·电动现象第17-19页
   ·分子动力学模拟的原理第19-20页
   ·分子动力学模拟细节第20-25页
     ·势能模型的设定第20页
     ·对比单位第20-21页
     ·系统初始化第21页
     ·周期性边界条件第21-22页
     ·选取积分步长和循环次数第22页
     ·截断势能与Verlet表列第22-24页
     ·温度控制第24-25页
     ·运动方程的积分算法第25页
     ·宏观物理量的统计第25页
   ·分子动力学模拟流程第25-26页
   ·本章小节第26-27页
3 自由体系中溶剂分子的密度分布及自扩散系数第27-29页
   ·水分子的密度分布第27页
   ·水分子的自扩散系数第27-28页
   ·本章小节第28-29页
4 T型微-纳米通道中DNA链运动的分子动力学模拟第29-39页
   ·DNA链在微-纳米通道中基于熵变化的分离机制第29-31页
   ·计算模型第31-35页
     ·T型微-纳米通道模型第31-33页
     ·粒子的运动方程第33-35页
   ·T型微-纳米通道中电场的计算第35-37页
   ·本章小节第37-39页
5 计算结果及讨论第39-52页
   ·T型微-纳米通道中离子的分布第39-40页
   ·DNA链穿越T型微-纳米通道过程中的构象变化第40-42页
   ·DNA链穿越T型微-纳米通道过程中的轨迹第42-43页
   ·外加电场对DNA链穿越T型微-纳米通道的影响第43-44页
   ·不同链长的DNA在T型微-纳米通道中的相对迁移率变化第44-45页
   ·DNA链在熵受限通道内迁移过程中的能量变化第45-47页
   ·DNA链穿越T型微-纳米通道的时间随链长的变化第47-48页
   ·T型微-纳米通道内电渗流对DNA链迁移的影响第48-49页
   ·纳米通道长度及深度对DNA链迁移速率的影响第49-51页
   ·本章小节第51-52页
结论第52-53页
参考文献第53-57页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第57-58页
致谢第58-59页

 
 
论文编号BS223,这篇论文共59
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